Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VwceQ3U515 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VwceQ3U515 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VwceQ3U515 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VwceQ3U515 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VwceQ3U515 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VwceQ3U515 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VwceQ3U515 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VwceQ3U515 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VwceQ3U515 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VwceQ3U515 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VwceQ3U515 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VwceQ3U515 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VwceQ3U515 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms