Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp4Q3U4B1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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