Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Kdm4dQ3U2K5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kdm4dQ3U2K5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms