Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam193bQ3U2K0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fam193bQ3U2K0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam193bQ3U2K0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms