Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vars2Q3U2A8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms