Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pag1Q3U1F9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms