Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U1D9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U1D9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3U1D9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3U1D9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U1D9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U1D9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U1D9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U1D9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U1D9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms