Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d2bQ3U0J8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms