Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hbq1bQ3U0A6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hbq1bQ3U0A6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms