Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms