Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XylbQ3TNA1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms