Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms