Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.2 ms