Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms