Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb38Q3LR78 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbtb38Q3LR78 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms