Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Trpm1Q2TV84 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms