Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms