Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna5Q2MKA5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms