Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Shroom4Q1W617 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Shroom4Q1W617 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Shroom4Q1W617 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Shroom4Q1W617 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Shroom4Q1W617 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Shroom4Q1W617 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Shroom4Q1W617 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Shroom4Q1W617 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Shroom4Q1W617 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
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