Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fgfbp3Q1HCM0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fgfbp3Q1HCM0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fgfbp3Q1HCM0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fgfbp3Q1HCM0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfbp3Q1HCM0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfbp3Q1HCM0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfbp3Q1HCM0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfbp3Q1HCM0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfbp3Q1HCM0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfbp3Q1HCM0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfbp3Q1HCM0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfbp3Q1HCM0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfbp3Q1HCM0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfbp3Q1HCM0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfbp3Q1HCM0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfbp3Q1HCM0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfbp3Q1HCM0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfbp3Q1HCM0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfbp3Q1HCM0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfbp3Q1HCM0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfbp3Q1HCM0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms