Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cers3Q1A3B0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cers3Q1A3B0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms