Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd3Q14AI6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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