Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StumQ0VBF8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms