Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem52bQ0VBF2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms