Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb8Q0VBD0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms