Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vps8Q0P5W1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms