Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms