Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kndc1Q0KK55 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kndc1Q0KK55 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kndc1Q0KK55 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms