Protein–RNA interactions for Protein: Q09200

B4galnt1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt1Q09200 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
B4galnt1Q09200 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4galnt1Q09200 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms