Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13bQ07968 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13bQ07968 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13bQ07968 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13bQ07968 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
F13bQ07968 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms