Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col9a2Q07643 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms