Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Col17a1Q07563 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col17a1Q07563 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Col17a1Q07563 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms