Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NrepQ07475 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NrepQ07475 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NrepQ07475 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NrepQ07475 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NrepQ07475 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms