Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cntn3Q07409 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cntn3Q07409 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms