Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms