Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrstQ06666 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SrstQ06666 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrstQ06666 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SrstQ06666 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrstQ06666 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrstQ06666 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrstQ06666 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrstQ06666 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrstQ06666 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrstQ06666 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrstQ06666 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrstQ06666 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrstQ06666 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrstQ06666 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrstQ06666 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrstQ06666 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrstQ06666 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrstQ06666 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SrstQ06666 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrstQ06666 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrstQ06666 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrstQ06666 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrstQ06666 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrstQ06666 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrstQ06666 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrstQ06666 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms