Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cab39Q06138 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms