Protein–RNA interactions for Protein: Q059Y8

Dcst1, E3 ubiquitin-protein ligase DCST1, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcst1Q059Y8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dcst1Q059Y8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dcst1Q059Y8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms