Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sox8Q04886 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms