Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CkbQ04447 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CkbQ04447 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CkbQ04447 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CkbQ04447 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CkbQ04447 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CkbQ04447 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CkbQ04447 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CkbQ04447 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CkbQ04447 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CkbQ04447 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CkbQ04447 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CkbQ04447 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CkbQ04447 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CkbQ04447 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CkbQ04447 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CkbQ04447 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CkbQ04447 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CkbQ04447 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CkbQ04447 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CkbQ04447 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CkbQ04447 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CkbQ04447 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CkbQ04447 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CkbQ04447 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CkbQ04447 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CkbQ04447 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CkbQ04447 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms