Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scg2Q03517 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scg2Q03517 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms