Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms