Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl7Q03366 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms