Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkczQ02956 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkczQ02956 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms