Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1sQ02789 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms