Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GscQ02591 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GscQ02591 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GscQ02591 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GscQ02591 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GscQ02591 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GscQ02591 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GscQ02591 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GscQ02591 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GscQ02591 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GscQ02591 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GscQ02591 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GscQ02591 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GscQ02591 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GscQ02591 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GscQ02591 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GscQ02591 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GscQ02591 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GscQ02591 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GscQ02591 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GscQ02591 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GscQ02591 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GscQ02591 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GscQ02591 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GscQ02591 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GscQ02591 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GscQ02591 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GscQ02591 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GscQ02591 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GscQ02591 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GscQ02591 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GscQ02591 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GscQ02591 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GscQ02591 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GscQ02591 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GscQ02591 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GscQ02591 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GscQ02591 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GscQ02591 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GscQ02591 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GscQ02591 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GscQ02591 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GscQ02591 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GscQ02591 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GscQ02591 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GscQ02591 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GscQ02591 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GscQ02591 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GscQ02591 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GscQ02591 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GscQ02591 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GscQ02591 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GscQ02591 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GscQ02591 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GscQ02591 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GscQ02591 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GscQ02591 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GscQ02591 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GscQ02591 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GscQ02591 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GscQ02591 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GscQ02591 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GscQ02591 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GscQ02591 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GscQ02591 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GscQ02591 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GscQ02591 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GscQ02591 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GscQ02591 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GscQ02591 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GscQ02591 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GscQ02591 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GscQ02591 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GscQ02591 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GscQ02591 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GscQ02591 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GscQ02591 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GscQ02591 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GscQ02591 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GscQ02591 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GscQ02591 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GscQ02591 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GscQ02591 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GscQ02591 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GscQ02591 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GscQ02591 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GscQ02591 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GscQ02591 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GscQ02591 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GscQ02591 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GscQ02591 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GscQ02591 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GscQ02591 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GscQ02591 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GscQ02591 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GscQ02591 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GscQ02591 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GscQ02591 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GscQ02591 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GscQ02591 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms