Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Htr1fQ02284 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htr1fQ02284 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htr1fQ02284 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms