Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly9Q01965 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms