Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms