Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EgfrQ01279 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EgfrQ01279 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EgfrQ01279 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms